英特爾、聯(lián)想攜手華大基因，加速新型冠狀病毒基因組分析

英特爾和聯(lián)想為華大基因提供的技術(shù)包括一個大型高性能計算集群，可用于處理從華大DNB  SEQ-T7測序系統(tǒng)讀取的高通量數(shù)據(jù)。華大基因的研究人員將能夠通過新的高性能計算和基因組分析技術(shù)，以及來自英特爾和聯(lián)想的相關(guān)資源和專業(yè)知識，進(jìn)一步加快對新型冠狀病毒基因組特征的研究。這項技術(shù)將支持科學(xué)家研究病毒模式的毒性和傳播，以及病原體和宿主之間的相互作用，從而為流行病學(xué)和疫苗設(shè)計研究做出貢獻(xiàn)。這些努力對于創(chuàng)造更好的診斷方法和設(shè)計有效的疫苗或其他保護(hù)措施(如免疫療法)是必要的。

通過這次合作，華大基因?qū)⒗^續(xù)優(yōu)化其新型冠狀病毒檢測試劑盒，并獲得大量有價值的信息。這些信息將有助于確定未來開發(fā)有效疫苗或治療的潛在目標(biāo)方法。通過英特爾和聯(lián)想，聯(lián)想的共同努力，超級計算技術(shù)支持和優(yōu)化了“基因組優(yōu)化和可擴(kuò)展性工具”(簡稱GOAST)，該工具首先由英特爾？基因組分析工具獲得(經(jīng)選定解決方案驗證)，可將全基因組測序和全外顯子測序的計算速度加快40倍，幫助華大優(yōu)化計算過程，高效處理數(shù)據(jù)，更快地生成可靠的基因組分析結(jié)果，從而縮短科研和臨床觀察的時間。

“目前，我們對這種新型冠狀病毒還有很多不了解的地方。通過分析病毒基因組數(shù)據(jù)，華大基因加速了對感染者的快速識別和基因組特征的研究，而這些任務(wù)需要巨大的計算資源，而這正是我們可以發(fā)揮作用的地方。”英特爾營銷集團(tuán)副總裁兼中國區(qū)總經(jīng)理王銳，表示：“因此，我們緊密合作，為在防疫第一線進(jìn)行病毒研究的科學(xué)家提供更多的計算資源和專業(yè)支持，希望與狡猾的病毒賽跑，幫助防控疫情。拯救更多生命。”

聯(lián)想集團(tuán)高級副總裁、企業(yè)技術(shù)集團(tuán)總裁童夫堯，表示：“新型冠狀病毒疫情影響全國人民的心靈。作為世界領(lǐng)先的高性能計算制造商，聯(lián)想一直致力于為生命科學(xué)研究提供計算能力支持。來自英特爾和聯(lián)想的大數(shù)據(jù)分析以及健康和生命科學(xué)專家將整合我們的資源和專業(yè)知識，幫助解決當(dāng)前面臨的嚴(yán)峻挑戰(zhàn)，并促進(jìn)健康和生命科學(xué)的發(fā)展。”

在基因測序中，每毫升體液通常含有數(shù)百萬個不同的病毒體，每個病毒體的基因組含有約3萬個DNA堿基或字母。華大基因正在對許多感染患者和疑似感染患者的微生物進(jìn)行測序，因此這些研究將產(chǎn)生大量的結(jié)核病水平甚至結(jié)核病水平的數(shù)據(jù)。為了高效快速地處理這些重要數(shù)據(jù)，需要采用更先進(jìn)的HPC基礎(chǔ)設(shè)施、計算技術(shù)和優(yōu)化的基因組分析方法。

總部設(shè)在深圳，的華大基因公司是專注于生命科學(xué)和基因研究的世界領(lǐng)先公司之一。基因首席信息官金表示：“基因已經(jīng)對數(shù)百份臨床樣本進(jìn)行了測序，以分析和區(qū)分感染的并發(fā)癥。生物信息學(xué)領(lǐng)域的技術(shù)，如基因組比對、基因組組裝、基因組注釋和病毒核酸片段的系統(tǒng)分析，是一個高密度的計算過程，因此充足的高性能計算對于提高分析效率非常重要。能夠使用最新的高性能計算和基因組分析技術(shù)是提高分析效率的重要因素。該設(shè)備和技術(shù)將加快新型冠狀病毒感染者的快速鑒定和病毒基因組特征的研究，為新型冠狀病毒精準(zhǔn)的診斷、治療和疫情防控提供有力支持。”